Persona 5 explore les conflits internes et externes d’un groupe de lycéens singuliers – le protagoniste et les divers compatriotes qu’il rencontrera au fil du scénario – qui mènent une double vie en tant que Phantom Thieves.

Derrière le quotidien propre à tous les lycéens de Tokyo – études, activités extrascolaires, emplois à temps partiel – ils vivent également des aventures fantastiques en se servant de dons surnaturels pour s’introduire dans le cœur d’autrui. Leur pouvoir provient de la Persona, composant de la personnalité défini par Jung.

Les héros du jeu sont conscients que la société nous force à porter un masque pour protéger nos faiblesses internes. C’est en arrachant littéralement ce masque pour affronter ce qu’ils sont au plus profond d’eux-mêmes que les héros éveillent leur pouvoir inné et s’en servent pour aider les autres.

À terme, les Phantom Thieves comptent modeler leur environnement en fonction de leurs perceptions et voir clair à travers les masques de notre société.